Reconstruite l'ADN mitochondrial de la première femme

Documents

Archive contenant un répertoire avec un fichier pdf qui explique le projet et des fichiers (vides pour la plupart, à vous des les écrire). Le fichier pdf contient, entre autre, en dernière page, la grille de notation de votre projet.

Le fichier mtDNA.fasta.zip contient les données d'ADN mitochondrial pour plusieurs dizaines de milliers de femmes. Ce fichier, qui est compressé par l'algorithme correspondant au format zip, fait 128 Mo. Décompressé, il y a 1 Go de données. Heureusement que vous avez une machine pour faire le boulot ! Vous trouverez 3 enregistrements ADNmt dans le fichier mtDNA_example.fasta.

Rendu du travail

Vous rendrez votre travail sous la forme d'une archive groupe01.zip.

Matrice de points

Pour comparer deux séquences ADN, on peut aussi faire des matrices (image matricielle) de point. Compléter le fichier dot-plot-eleve.py. Une fois fini, comparer deux séquences d'ADN mitochondrial. A mettre dans votre archive à rendre !

2ème partie du projet

projet_partie2.py